Análisis bioinformático del genoma del Mycobacterium Tuberculosis. UNAN-MANAGUA 2008-2009

La bioinformática es la aplicación de tecnología computacional a la gestión y análisis de información biológica, principalmente a nivel molecular. Esto representa un gran potencial para el conocimiento de patologías como la tuberculosis (TB) cuya patogenia es compleja y aún no está totalmente diluci...

Full description

Main Authors: Miranda Calero, Samantha Alexandra, Cerda Cruz, Elia María
Format: Tesis
Language: Español
Español
Published: 2010
Subjects:
Online Access: http://repositorio.unan.edu.ni/92/
http://repositorio.unan.edu.ni/92/1/88767.pdf
http://repositorio.unan.edu.ni/92/7/88x31_cc.png
Summary: La bioinformática es la aplicación de tecnología computacional a la gestión y análisis de información biológica, principalmente a nivel molecular. Esto representa un gran potencial para el conocimiento de patologías como la tuberculosis (TB) cuya patogenia es compleja y aún no está totalmente dilucidada, además se encuentra en aumento por la incidencia e incremento de múltiples factores de riesgo, su tratamiento y métodos de diagnóstico se enfrentan a inconvenientes como el desarrollo de cepas multi y extremadamente resistentes y el desarrollo de tuberculosis inespecíficas y/o cuyo agente etiológico no es el Mycobacterium tuberculosis. En este estudio se realizó un análisis bioinformático de los genomas de las cinco cepas secuenciadas en su totalidad y disponibles en la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica de Estados Unidos (NCBI), a fin de determinar las familias de proteínas, proteínas virulentas y los procesos específicos que éstas regulan en la patogenia, obteniendo como resultado la identificación de regiones con alto potencial para el desarrollo de drogas antituberculosas como también posibles métodos de diagnóstico. Para dicha selección se tomaron en cuenta parámetros como la especificidad de las proteínas, identidad de la secuencia entre las cepas analizadas, conocimiento de sus dominios, localización al ser expresadas y secreción, entre otros. Producto de lo anterior determinamos que la familia PE es una región ideal para el desarrollo de vacunas, las proteínas Mpt53, Cfp7, proteína de resistencia a antibióticos, y en menor grado la proteína BLAC y la proteína similar a la betalactamasa, son objetivos viables para el desarrollo de drogas antituberculosas. Como potenciales métodos de diagnóstico se identificaron a las familias PPE y PE_PGRS, la proteína Mpt63, Esat 6, Cfp7 y Cfp2. Por otro lado se estableció que la presencia de la pirazinamidasa/nicotinamidasa pncA en los genomas, no es la única responsable de la resistencia a la pirazinamida. La cepa con mayor resistencia a antibióticos es la KZN1435 y la cepa H37Rv es la más completa en cuanto a las proteínas virulentas que codifica. Así mismo se determinó que el segmento IS6110 y las transposasas son los únicos elementos transponibles presente en todas las cepas.